To właśnie w Czarnych Radom Jakub Bednaruk zaczynał „poważne granie” w sezonie 1996/1997. Po jednych rozgrywkach rozgrywający opuścił klub, ale wrócił do niego kilka lat później i spędził w nim kolejne dwa sezony. Na krótko Bednaruk trafił do radomskiego klubu także w 2009 roku, niedługo później kończąc karierę w AZS Politechnice Warszawskiej.

Po zawieszeniu butów na kołek Jakub Bednaruk wszedł na ścieżkę trenerską zostając w warszawskim klubie jako drugi trener. Po dwóch sezonach stał się pierwszym i ze stołecznym zespołem pracował przez pięć lat. Następnie Bednaruk trafił do Chemika Bydgoszcz, w którym spędził dwa sezony. Ostatnio natomiast pracował z MKS-em Będzin.

W roli pierwszego szkoleniowca "Wojskowych" Jakub Bednaruuk zastępuje Dimę Skorego, który wcześniej był asystentem Roberta Prygla.